Die Auslosung für das Viertelfinale hat folgende Paarungen ergeben.
Brechin City (WEL) - Volin Lutsk (OEL)
ZSKA Kiew (OEL) - HSH Olafsvik (NEL)
Recreativo de Huelva (WEL) - AC Horsens (NEL)
CF Malaga (WEL) - Motril CF (WEL)
Hinspiele: 2.WE 2012'2
Rückspiele 4.WE 2012'2
Brechin City (WEL) - Volin Lutsk (OEL)
ZSKA Kiew (OEL) - HSH Olafsvik (NEL)
Recreativo de Huelva (WEL) - AC Horsens (NEL)
CF Malaga (WEL) - Motril CF (WEL)
Hinspiele: 2.WE 2012'2
Rückspiele 4.WE 2012'2